V schématu VAT Margin Scheme se DPH platí pouze z rozdílu mezi prodejní cenou a kupní cenou. Schéma je založena na směrnici EU 2006/112/ES. Schéma se používá například v obchodu s ojetým zbožím nebo ojetými automobily, kdy je zboží zakoupeno od spotřebitele a dále prodáno. Systém je dobrovolný.